《名侦探柯南 Episode "ONE" 变小的名侦探》讲述了高中生侦探工藤新一在与青梅竹马毛利兰同游米花水族馆时发生的故事。此行的目的是为兰的父母——毛利小五郎与妃英理策划一场“水族馆惊喜重逢恋爱复活大作战”。然而，欢乐的气氛被一场突如其来的命案打破。新一敏锐地察觉到血腥味，迅速判断出案件的发生，并让兰呼叫工作人员。面对兰的疑惑，新一沉声解释了自己的推理。随着案情的发展，新一逐渐锁定了真凶，而这场案件背后竟隐藏着通往他命运的转折点——与黑衣组织的宿命邂逅。故事展现了新一化身江户川柯南前夕的关键时刻，揭示了更多角色的内心活动与未详尽描述的细节。