21世纪初，日本横滨因不明原因发生剧烈地壳变动，形成半径30公里的隆起区域"Lost Ground"。日本政府实施复兴计划后，这里分裂为富裕的"inner"和贫瘠的"outer"两个阶层。更令人不安的是，当地新生儿开始觉醒名为"Alter"的超能力，这些能力者逐渐沦为暴徒。为应对危机，警方组建了由Alter能力者组成的特殊部队"HOLY"。故事围绕来自outer区的叛逆少年数马展开，他意外卷入能力者纷争，并与HOLY的精英战士刘凤相遇。两人从敌对到合作，与女警由诧加奈美一起，在这片混乱的土地上追寻真相，对抗隐藏在Lost Ground背后的巨大阴谋。