万圣节到了，神秘公司的成员们——弗雷德、达芙妮、维尔玛、长毛和史酷比正准备好好享受这个难得的假期。然而，一起突发事件打乱了他们的计划，并威胁到了参加万圣节游行车会的民众的安全。经过调查，他们发现幕后黑手竟是一个想要报复神秘公司的新敌人，而这个敌人异常神秘且强大。为了揭穿这个幕后黑手的阴谋，神秘公司不得不与他们的宿敌——史酷比历史上每一个万圣节装扮背后的邪恶策划者强纳森·克莱恩博士合作。当然，合作是有条件的。这个不可预测的新盟友给史酷比和他的朋友们带来了不少麻烦，但他们也将学习到一些怪异的新技巧，甚至穿上他们最知名的反派服装以混淆对手的视听。最终，他们依靠亲密无间的合作和出其不意的策略，在这个特殊的万圣节之夜成功拯救了世界。