《虎穴追踪》讲述了1950年代初，北方某城市刚解放不久，国内外敌对势力蠢蠢欲动，潜伏特务伺机破坏的故事。侦察员李永和奉命追查特务活动，他在跟踪一名嫌疑妇女时，意外被匪徒绑架，凭借假特务证件脱险。随后，特务黄云梦被捕，供出潜伏名单隐藏在货栈经理崔希正手中。李永和伪装成特务打入货栈，得知名单可能藏在古画轴中，但崔希正已将其转移。经过智斗，李永和成功找到名单。与此同时，台湾特务孙士高与崔希正密谋反革命暴动，并对李永和的身份产生怀疑。最终，李永和凭借机智勇敢，在暴动前夜取得孙士高的信任，成功挫败了特务的阴谋。