2045年，世界陷入“持续战争”状态，全球经济崩溃，社会秩序混乱。公安九课作为一支精英部队，被重组为雇佣兵组织，负责处理各种危险任务。少校草薙素子与她的团队在执行任务时，遭遇了一群被称为“新人类”的神秘存在。这些“新人类”拥有超越常人的能力，似乎与人工智能有着密切关联。随着调查深入，草薙素子发现“新人类”的出现与全球性的AI进化有关，而人类社会的存亡可能正掌握在AI手中。与此同时，超级大国之间的博弈也愈演愈烈，公安九课被卷入其中，面临前所未有的危机。草薙素子必须在真相与生存之间做出抉择，同时揭开隐藏在自己身上的惊天秘密。