《怪盗基德（中配）》讲述了高中生黑羽快斗的双重身份故事。表面上看，他只是一个普通的高中生，活泼开朗，与青梅竹马中森青子过着平凡的生活。然而，实际上他是技艺高超的怪盗基德，专门盗取珍贵的宝石，并以华丽的魔术手法戏弄警方。一次偶然的机会，快斗发现了父亲黑羽盗一的秘密——父亲曾是初代怪盗基德，并在一次行动中神秘失踪。为了查明真相，快斗决定继承父亲的衣钵，继续以怪盗基德的身份行动。在执行任务的过程中，他不仅要面对警方的追捕，还要揭开隐藏在宝石背后的秘密，同时还要在校园生活中隐藏自己的身份，避免被青子和其他朋友发现。故事充满了智斗、魔术与悬疑，展现了快斗在双重身份下的冒险与成长。