《勇者王GaoGaiGar Final》的故事發生在動畫版結局的兩年後。天海護乘坐加里安在宇宙中搜索殘存的佐達，意外發現了收集宇宙中的暗黑物質來再生三重連太陽系的「Parts Q Machine」及其執行者索魯11遊星主。遊星主認為宇宙和三重連太陽系無法共存，拒絕了護的提議。護決定採取行動，利用複製人和複製的加里安吸引遊星主的注意力，成功奪取了Parts Q Machine，並將真正的加里安藏匿在遊星主不敢接近的G水晶中。然而，複製人卻被遊星主俘獲。GGG團隊為了阻止遊星主的計劃，前往已經毀滅的三重連太陽系，展開最後的戰鬥。