《八犬传 东方八犬异闻 第二季》延续了第一季的奇幻冒险故事。五年前，大冢村在一场火灾中被烧毁，幸存下来的犬冢信乃和犬川庄介发现自己拥有特殊的力量。五年后，信乃在帝都再次遇见了当年将他救出火海的里见莉芳。为了实现与莉芳的约定，信乃答应为他寻找刻有孝、义、信、悌、智、礼、忠、仁八颗明珠的主人。这些明珠象征着古代八犬士的精神力量，而信乃的任务是找到这些明珠的主人，使古代八犬士在新世界复活。在寻找的过程中，信乃和庄介不仅要面对来自帝国教会的追捕，还要揭开大冢村火灾背后的真相。随着故事的发展，他们逐渐发现自己的力量与八犬士的命运息息相关，并必须面对新的挑战与敌人。