《四圣兽～几千个昼与夜篇～》讲述了天界在宙斯的统治下迎来和平时代的故事。宙斯册封青龙刚、白虎凯、朱雀零、玄武真、麒麟犹达和凤凰路卡为圣天使，天界一度繁荣昌盛。然而，随着时间的推移，部分天使逐渐堕落，沉迷于享乐。潘多拉因遭受凌辱而心生怨恨，麒麟犹达请求宙斯惩罚堕落的天使。这一事件成为天界和平崩塌的导火索，原本和谐的天界逐渐陷入混乱与纷争。四位圣兽在动荡中面临抉择，他们必须守护天界的秩序，同时面对自身内心的挣扎与考验。故事展现了天使们在光明与黑暗之间的斗争，以及他们在数千个昼与夜中经历的成长与蜕变。