《使命 第二季》延续了首季的科幻悬疑基调。1967年苏联联盟号飞船在火星神秘失联后，当代欧洲航空局与富豪迈耶合作启动载人火星任务。心理学家珍妮临危受命加入尤利西斯号机组，在十个月航行中，成员们逐渐陷入心理危机。当飞船抵达火星轨道时，机组发现当年失联的苏联飞船竟完好停泊在火星表面。随着调查深入，他们遭遇超越认知的诡异现象，同时飞船系统开始出现不明故障。地面指挥中心的通讯突然中断，而舱内成员相继出现记忆错乱症状。当珍妮在飞船数据库发现与自己童年完全吻合的陌生影像时，整个火星任务背后隐藏的时空谜团逐渐浮出水面。