《心灵想要大声呼喊》讲述了因童年创伤封闭内心的少女成濑顺的故事。幼时因言语不慎导致家庭悲剧，顺从此失去说话能力，独自承受着沉重的负罪感。升入高中后，她与性格迥异的同学坂上拓实、田崎大树和仁藤菜月被分到"地域沟通交流会"小组，负责在文化祭上表演音乐剧。最初四人矛盾不断，班级同学也消极应付。当排练陷入僵局时，长期沉默的顺突然开口唱歌，震撼了所有人。随着排练推进，四人各自隐藏的心结逐渐浮现——拓实对前女友的愧疚、大树因伤放弃棒球的遗憾、菜月纠结的暗恋心事。通过音乐剧的创作过程，他们学会直面内心创伤，最终在舞台上用歌声完成了真正的心灵对话。顺也在这场青春救赎中，逐渐解开束缚自己多年的心锁。