《Code Geass 亡国的阿基德》的故事發生在2017年，超級大國“不列顛尼亞帝國”正朝著稱霸世界的目標邁進，已征服了世界近三分之一的版圖。七年前被改稱為“11區”的日本出現了動亂，激發了世界各地對抗不列顛尼亞帝國的鬥志。帝國與統領部分歐洲和非洲勢力的E.U.曾達成停戰協議，但由於動亂的爆發，和平關係随之破裂。故事聚焦於E.U.軍隊中的特種部隊“W0”，成員日向阿基德在一次任務中意外獲得Geass能力，這是一種能夠操控他人意志的力量。阿基德與隊友蕾拉·瑪露卡爾等人一同對抗帝國軍隊，並逐漸揭開帝國與E.U.之間複雜的戰爭真相。他們在戰火中尋找自我與信念，同時也面臨著Geass能力帶來的巨大代價與抉擇。