岩仓玲音的同学四方田千砂突然自杀，没有任何前兆的自杀事件让同学们陷入困惑。一周后，玲音收到了已死的千砂发来的短信，两人通过手机开始交流。玲音回到家后，利用父亲给她的电脑与千砂继续联系。千砂透露她自杀是因为“已经不需要身体了，没有身体，我可以在wired网络中继续活着”。不解的玲音开始调查千砂的自杀事件，逐渐发现wired网络背后隐藏的巨大秘密，同时她自己的身世也变得扑朔迷离。随着玲音深入网络世界，真相逐渐浮出水面，耳边不断响起千砂的话：“我生存在wired中，因为神在那里。”玲音不得不面对网络世界与现实之间的复杂关系，探寻自己存在的意义。