《名侦探柯南：异次元的狙击手》讲述的是柯南与少年侦探团在东京新地标铃木塔的开幕仪式上遭遇狙击事件的故事。当天，众人正在塔顶欣赏东京的壮丽景色，突然一发子弹击碎了窗户，击中了一名男子。柯南迅速利用追踪眼镜锁定狙击手的位置，发现对方竟是从距离塔楼数公里外的摩天大楼顶端开枪。随着调查深入，柯南发现这起事件与一名退役美军狙击手蒂莫西·亨特有关，他曾因战争创伤而心理崩溃。与此同时，FBI探员赤井秀一和茱蒂·斯泰琳也介入调查，试图阻止更大的阴谋。柯南必须在混乱中解开真相，阻止更多无辜者受害，并揭示隐藏在狙击事件背后的真相。