《机神咆吼》讲述了一个魔术理论与科学并行的世界，因魔导技术而繁荣至极的大都市Arkham City正面临恐怖犯罪组织“Black Lodge”的威胁。该组织由绝世无双的邪恶大魔术师Master Terion领导，企图利用深层魔术力量召唤最强魔导机器人“鬼械神”进行破坏。为对抗“Black Lodge”，Arkham City的守护者“霸道财阀”结合魔术理论制造了最强机器人“Demonbane”，但激活它需要一本拥有强大力量的魔导书。霸道财阀统帅霸道琉璃委托三流侦探大十字九郎寻找魔导书。在搜寻过程中，九郎遇见被“Black Lodge”追缉的精灵少女Al Azif，她是最强魔导书的化身。两人的相遇唤醒了沉睡于地下的“Demonbane”，故事由此展开，一场壮丽的战斗即将上演。