《精灵宝可梦 剧场版1：超梦的逆袭》讲述了小智、小霞和小刚收到一封神秘招待券，邀请他们前往新岛参加由“最强宝可梦训练家”举办的宴会。抵达后，他们发现主办者是火箭队科学家制造出的强大宝可梦——超梦。超梦对人类充满敌意，认为宝可梦不应被人类控制，因此复制了许多宝可梦，并邀请训练家们前来对决，试图证明宝可梦的强大。在激烈的战斗中，小智和他的皮卡丘展现出非凡的勇气与友情，最终超梦开始质疑自己的信念。梦幻的出现更是让超梦意识到宝可梦与人类之间的纽带并非简单的控制与被控制。最终，超梦与梦幻一同离开，留下小智一行人继续他们的冒险旅程。