《绝灭危愚少女》讲述了在繁华都市中，热爱魔术的少女等等力天音与NOUGHT剧团的故事。天音在剧团中卖力表演，却因观众冷淡反应而感到失落。她渴望让所有人理解“ISH能力”下的魔术之美，并试图邀请团长不动奈奈枝加入表演，但未能成功。一次偶然的机会，天音遇到了超人气剧团“I·A·M”的天才魔术师AYA，AYA识破了她的ISH能力，并邀请她加入自己的剧团。天音跟随AYA来到新剧团，逐渐揭开ISH能力的秘密，并面对一系列不可思议的命运挑战。在追寻梦想的过程中，天音不仅要克服外界的质疑，还需直面内心的困惑与恐惧。故事展现了少女们在魔术与超能力交织的世界中，如何突破自我、追逐梦想的热血历程。