公元2010年，全球规模的“超级飓风”席卷世界，导致人口从80亿骤减至50亿，经济与军事均衡彻底崩溃。北美、俄罗斯、北欧被冰雪覆盖，平原地区沉入大海，世界地图剧变，进入混沌时代。日本政府通过建立经济特区，借助“力量辅助”技术实现了部分复兴。然而，特区外的地区贫困加剧，贫民区不断扩大。统治阶级“Logos”将“力量辅助”技术用于军事，将贫困阶级称为“Levinas”并加以排斥。2035年，前特殊部队“幻影”成员葛城丈与伙伴鹤泽仁脱离组织后，偶遇神秘少女登户沙那。围绕沙那，各方势力纷争不断，三人的命运交织，逐渐揭开隐藏在历史背后的真相。他们前进的方向，将决定世界的未来。