《Macross Plus OVA》的故事發生在2040年，圍繞三位兒時好友——勇·戴森、卡爾德·波曼和謬芳容展開。勇和卡爾德都成為了統合軍的飛行員，謬則放棄了歌手的夢想，轉而成為一名商人。三人因一次意外分道揚鑣，多年後再次重逢。統合軍正在進行「超新星計畫」，開發新一代可變形戰鬥機，勇和卡爾德分別駕駛不同的原型機展開競爭。與此同時，謬被捲入了一場涉及人工智能的陰謀，她的過去與未來的命運交織在一起。隨著戰鬥的升級，三人不得不面對彼此的過去與矛盾，並在戰爭與科技的浪潮中尋找自己的位置。故事融合了機戰、情感與科幻元素，展現了人類在未來科技與戰爭中的掙扎與成長。