公元2220年，地球再次面临灭顶之灾。一个质量达太阳300倍的黑洞正以惊人速度逼近地球，将在半年内吞噬整个星球。此时，沉没在海底17年的大和号突然接收到来自伊斯坎达尔星的求救信号。原船员们重新集结，在森雪、古代进等老成员的带领下，大和号从海底升起，搭载着人类最后的希望启航。他们必须在黑洞吞噬地球前，穿越危险的小行星带和敌方舰队封锁，前往伊斯坎达尔获取拯救地球的关键技术。途中，大和号遭遇加米拉斯残党的疯狂阻击，更发现黑洞危机背后隐藏着惊天阴谋。面对时间与空间的双重考验，船员们必须突破极限，完成这场跨越生死的终极营救任务。