某天，怪奇现象调查组织SSP的成员收到了一件神秘的物品——艾克斯奥特曼的变身器艾克斯终端。与此同时，特殊防卫队Xio的队员大空大地在一次行动中不慎落入敌人陷阱，被迫与艾克斯奥特曼解除了一体化的联系，随后大地下落不明。艾克斯奥特曼不得不寻求SSP和欧布奥特曼人间体红凯的帮助，寻找失蹤的大地。与此同时，邪恶外星女魔头穆鲁娜奥企图将地球变成宝石据为己有，而暗黑军团伽古拉也在暗中蠢蠢欲动，企图发动更大的阴谋。地球陷入了前所未有的危机之中。欧布奥特曼、艾克斯奥特曼以及SSP成员们必须联手，共同对抗这些强大的敌人，拯救地球的命运。