在未来的星际移民时代，地球成为了外星难民的临时庇护所。黑衣警探组织作为秘密政府机构，专门处理外星移民相关事务。第三季中，警探搭档J和K面临新的挑战：一种能篡改记忆的外星病毒正在蔓延，导致人类与外星移民之间的矛盾激化。两人在调查过程中发现，病毒背后隐藏着星际犯罪集团的阴谋。与此同时，J意外发现自己童年记忆中的关键人物竟与外星势力有关。随着调查深入，他们必须在24小时内找到病毒源头，否则地球将陷入种族战争。本季延续了系列特有的无厘头风格，在紧张的任务中穿插着外星生物的搞笑日常，同时探讨了记忆与身份的主题。