《头文字D Second Stage》延续藤原拓海的赛车成长故事。在击败Red Suns车队后，拓海面临新挑战——帝王车队的LanEvo3车手须藤京一。惨败让拓海对AE86产生怀疑，此时父亲文太暗中为86换上赛车引擎。与此同时，拓海与茂木夏树的感情因误会陷入危机。高桥凉介组建新队伍Project D，邀请拓海与启介征战各地山路。第二季着重展现拓海在技术突破与心理成长，经典战役包括与碓冰崖女车手佐藤真子的对决，以及秋名山与赤城红太阳车队首领高桥凉介的终极较量。随着引擎轰鸣，拓海逐渐领悟职业车手应有的觉悟与器量。