东都体育场正举行东京Spirit对阵大阪钢巴的足球赛，柯南与少年侦探团兴奋观战。与此同时，毛利小五郎接到恐怖袭击威胁电话，随后目击汽车爆炸。犯人留下"蓝色的少年与蓝色的斑马，从天而降的雨……"的暗号，扬言若不及时破解将继续制造爆炸。小兰凭借对新一的了解成功解开暗号，阻止了更多伤亡。警方与毛利锁定数名嫌疑人展开调查，而暗处的犯人却策划着更大规模的袭击。柯南与时间赛跑，在球场与城市间穿梭，最终揭露犯人竟是因昔日足球比赛误判而怀恨在心的退役裁判。当炸弹在满座球场启动倒计时，柯南用精准射门将炸弹踢向高空化解危机，守护了无数观众的生命。