《黑名单》第二季延续了第一季的紧张氛围，故事在几个月后继续展开。FBI重新集结，补充了新成员，而雷蒙德·雷丁顿（詹姆斯·斯派德饰）的四人小组也迎来了一位新队友。雷丁顿，绰号“红魔”，是一位前政府特工，他掌握着全球最危险罪犯的黑名单。他与FBI探员伊丽莎白·基恩（梅根·布恩饰）继续合作，追捕这些罪犯。然而，随着调查的深入，基恩逐渐发现雷丁顿的真实身份和她自己的过去息息相关。第二季中，雷丁顿的动机和背景逐渐揭露，更多的阴谋和危险浮出水面。基恩在追捕罪犯的同时，也开始质疑雷丁顿的真实意图，两人的关系变得更加复杂。与此同时，新的威胁不断出现，FBI团队面临着前所未有的挑战。