《精灵宝可梦XY&Z》是“XY”系列的第三季，故事紧随XY2之后，讲述小智一行人在击败了第七道馆的道馆训练家葛吉花后，继续以收集齐八枚徽章为目标向映雪市进发。在旅途中，他们遇到了神秘的绿色生物“小软”（基格尔德·核心）以及为其目标而行动的神秘团体“闪焰队”。与此同时，小智和甲贺忍蛙之间发生了奇妙的羁绊变化，甲贺忍蛙逐渐展现出独特的形态——“小智版甲贺忍蛙”。随着闪焰队的阴谋逐渐浮出水面，小智和伙伴们必须联手阻止他们的邪恶计划，保护卡洛斯地区的和平。在激烈的战斗中，小智不断成长，朝着成为宝可梦大师的目标迈进，而他的冒险也将迎来新的挑战与机遇。