1999年，一艘外星宇宙战舰坠落到地球，人类花费十年时间将其修复并命名为“MACROSS”。2009年，MACROSS要塞正在举办偶像歌星林明美的演唱会，突然空袭警报响起，要塞开始变形。战斗中，飞行员一条辉驾驶变形战机救下一名少女，却因速度过快撞进外层舱室。安定后，辉发现救的是林明美。两人相识后，辉为了哄明美开心，偷开教练机带她兜风。敌人趁机出现，幸好朋友及时相救。经过一场混战，辉和早瀨未沙醒来时发现自己身处一个荒芜的星球。他们了解到，五十万年前，一个名为“普罗多”的古代文明分裂为由男性组成的“杰特拉帝”和由女性组成的“赫而特兰帝”，双方因战争导致文明衰退。为了阻止战争，辉和未沙决定寻找失传已久的古老情歌，希望能唤醒人们对爱与和平的记忆。最终，这首情歌在决战中响彻宇宙，成功化解了双方的仇恨，拯救了人类的命运。