《闪电十一人GO2时空之石》延续雷门足球队的热血征程。松风天马与伙伴们参加"神圣之道"足球大赛时，意外卷入决定下一届圣帝的神秘赛事。当雷门队收到强制合宿命令后，他们发现第五部门正暗中操控足球界。面对足球热情衰退的现状，队员们突破重重阻碍，在时空穿梭中遭遇历代传奇选手——包括十年后的圆堂守、鬼道有人等前辈。随着狮鹫兽计划的真相逐渐揭露，天马等人必须用最纯粹的足球之心对抗操控比赛的力量，在跨越时空的比赛中重新点燃足球之魂。故事融合了超次元足球对战与少年成长主题，雷门队最终以究极羁绊唤醒沉睡的足球热情。