《高智能方程式ZERO》讲述了天才赛车手风见隼人在第十二届高智能方程式赛车（Cyber Formula）中的冒险与挑战。在前三场比赛中，隼人凭借高超的驾驶技术和阿斯拉达的支持，顺利取得了冠军。然而，在第四场预赛中，隼人突然听到刺耳的噪音，并在危急时刻凭借直觉避开了与对手雪铁的碰撞。这一举动让众人震惊，误以为他拥有超能力。然而，这只是隼人噩梦的开始。随着比赛的深入，隼人面临着越来越多的挑战和阴谋，他必须在赛车技术与心理压力之间找到平衡，继续追求自己的梦想。与此同时，他还要面对来自对手加贺城太郎等人的激烈竞争，以及与伙伴们之间的信任与背叛。隼人能否在这场高智能方程式的赛场上再次证明自己，成为真正的冠军？故事在紧张刺激的赛车对决与复杂的人际关系中展开。