《彩虹小马小马国女孩3友谊大赛》讲述了紫悦公主与她的朋友们在平行世界中的新冒险。故事开始于水晶帝国的珍贵王冠被偷窃，紫悦公主决定前往另一个平行世界寻找失窃的王冠。在这个平行世界中，紫悦发现自己变成了人类少女，而她的朋友们也化身为人类高中生。与此同时，平行世界中的坎特拉高中和克里斯泰洛高中即将举行一年一度的友谊大赛。紫悦与她的朋友们组队参赛，希望通过比赛增进两校的友谊。然而，比赛中出现了意外，神秘的力量威胁着参赛者的安全。紫悦和她的朋友们必须团结一致，运用友谊的魔法化解危机，最终找回王冠并巩固两校的友谊。