在《正义联盟与红白黑黄:超级英雄和猎人下》中，超人、蝙蝠侠、神奇女侠等英雄发现自己被传送到了一个陌生的世界，不仅变成了青少年模样，还失去了部分记忆。他们分别遇见了RWBY小队的鲁比、维斯、布莱克、杨以及JNPR小队成员。与此同时，这个世界的猎人们也察觉到环境出现了诡异的异常。随着调查深入，双方发现这一切都与神秘反派"遗存者"有关——他正在利用超能力"格林"扭曲现实。为了阻止世界被彻底摧毁，正义联盟与猎人团队必须联手合作。他们既要对抗"遗存者"制造的怪物，又要解开记忆谜团，最终在两个团队的默契配合下，找到了击败反派的关键方法，成功恢复了被篡改的现实秩序。