400万年前，为了逃离战乱连年的塞博坦星，被称为“微型金刚”的小型变形金刚种族驾驶宇宙船飞离了星球，然而，他们的太空船穿越时空之后，却坠落在地球上。400万年后，一位名为雷德的地球少年和同学们不经意在太空船中发现了其中一架微型金刚，微型金刚复活的讯号也在同时传到了汽车人和霸天虎手上。为了争夺微型金刚，两军前往地球，并且继续在塞博坦星的战争。雷德与他的朋友们卷入这场斗争，他们不仅要保护微型金刚，还要在汽车人和霸天虎的冲突中找到自己的立场。随着战斗的升级，雷德逐渐发现微型金刚背后的秘密，并意识到他们的力量可能改变整个宇宙的命运。最终，雷德和他的伙伴们与汽车人联手，共同对抗霸天虎的野心，试图为和平与正义而战。