《高机动幻想新结行军歌》讲述了1945年因黑月与幻兽的出现导致二战意外终结后的世界。50年后，日本仍持续与幻兽的激烈战斗。故事聚焦于远离前线的青森地区，这里从未出现过幻兽。精英女军官石田从东京振武台军官学校毕业后，被派往青森担任第108警护师团第4中队队长。然而这支缺乏实战经验的队伍纪律涣散、士气低迷。就在石田到任不久，青森首次遭遇幻兽袭击。面对突如其来的危机，石田带领这支散漫的中队仓促应战，而队员们出人意料的反应将决定这场战斗的走向。作品通过新兵部队与未知威胁的对抗，展现了战争阴影下人性的挣扎与成长。