水都奥多马雷是一座美丽的城市，相传这里有两隻传说神奇宝贝——拉帝欧斯与拉帝亚斯，它们秘密守护着城市的宝石心之水滴。小智一行人来到奥多马雷，参加了水上竞速赛后，从当地居民口中得知了这个传说。与此同时，闻名世界的怪盗姊妹出现，她们企图夺取心之水滴以掌控整座城市。怪盗姊妹利用探测器找到了能够变成人形的拉帝亚斯，试图通过她找到心之水滴的下落。小智偶然撞见了这一幕，决定阻止怪盗姊妹的计划，保护水都奥多马雷的和平。他与拉帝亚斯和拉帝欧斯联手，展开了一场惊险的冒险，最终成功阻止了怪盗姊妹的阴谋，守护了心之水滴和城市的安宁。