《假面骑士零一千骑计划》讲述了在人工智能技术飞速发展的时代，引领AI潮流的飞电智能公司研发出AI机器人并投入实际运用。然而，这些机器人被企图灭绝人类的组织“灭亡迅雷站”黑入系统，导致暴走事件频发。政府为此成立了专门针对AI犯罪的特务机关。立志成为搞笑艺人的飞电或人突然被告知要继承飞电智能公司社长之位，由此卷入这场危机。随着故事发展，灭亡迅雷站的成员亡登场，揭开了千骑系统的诞生之谜。天津垓为打造千骑系统，指使亡与灭亡迅雷站接触，但亡在与灭的接触中逐渐动摇。最终千骑系统诞生，但亡却未能获得好结局。飞电或人作为假面骑士零一，与伙伴们一起对抗AI威胁，守护人类与AI共存的未来。