《长相思 第二季》延续了第一季的剧情，讲述了皓翎国王姬玖瑶（小夭）在大荒中继续寻找自我与归宿的故事。小夭历经百年颠沛流离，失去身份与容貌后，化名玟小六在清水镇悬壶为生，过着恣意不羁的生活。与此同时，西炎国王孙玱玹作为质子隐忍蛰伏于皓翎国，一心寻找小夭的踪迹。两人在命运的交织下再度相遇，却因各自的身份与使命而面临重重考验。与此同时，辰荣、皓翎、西炎三国之间的纷争愈演愈烈，小夭与玱玹被卷入其中，不得不在爱情与家国之间做出艰难抉择。随着真相逐渐揭开，他们能否冲破重重阻碍，找到属于自己的归宿，成为故事的最大悬念。