就读帝丹高中二年级的工藤新一是一位拥有过人推理能力的高中生名侦探。他的青梅竹马毛利兰则是曾经荣获冠军的空手道高手。两人虽然两心相许，但始终没有表白。有一天，新一醒来后发现自己身处一个白色的密闭空间，身边的小兰也被手铐铐在一起。接着，新一看到小兰的父亲毛利小五郎也倒在房间里。三人完全想不起为何会被关在这里。后来，小五郎找到了一封给新一的信，信中表示这个白色房间是送给新一的礼物。新一意识到这是黑暗组织的阴谋，他必须利用自己的推理能力找出真相，拯救自己和小兰。在紧张的对决中，新一逐渐揭开了黑暗组织的秘密，最终成功逃脱，并与小兰的感情也得到了进一步的发展。