21世纪，地球恢复了昔日的和平，然而一颗陨石从宇宙坠落，陨石中藏有一个时空囊。地球和平联盟TPC的GUTS小队通过时空囊得知地球将面临巨大灾难。时空囊预言的两大怪兽“哥路渣”和“米路巴”相继出现，GUTS小队根据预言开始寻找隐藏在金字塔中的三大巨人石像。经过一番努力，GUTS队员们终于找到金字塔，但两大怪兽也随之而来。尽管GUTS小队拼死守护，三个巨人石像仍被破坏，仅剩一个完好。队员大伍的战机被击中，逃生装置失灵，危急关头，大伍化作光芒与最后一个石像结合，光之巨人“迪迦”因此复活，并与两大怪兽展开激烈战斗。与此同时，小学生新星勉在观看《盖亚奥特曼》时被卷入奇怪空间，见到了红色光球和一名站在火海中的女孩。第二天，这名叫七濑理沙的女孩竟出现在学校，勉在自家仓库中再次看到红色光球，故事逐渐展开。