《假面骑士利维斯往事：假面骑士贝尔》讲述了广见、一辉和维斯追捕人猿亡命徒时被困深山旅馆的悬疑故事。激战后逃亡的亡命徒引众人来到西园寺铃经营的旅馆，暴雨导致山体滑坡切断外界联系。旅馆内6人成为嫌疑对象：女主人铃、管家花轮真藏、女仆冰室美砂，以及住客蛟岛康夫、权田原太郎和上屋直人。警察追田现八郎加入调查时，权田原太郎离奇遇害。与此同时，科学家乔治联系警骑照井龙调查神秘怪人，而澡堂老板五十岚元太（原名白波纯平）被揭露是25年前诺亚组织的071号实验体，被植入基夫细胞后以假面骑士贝尔的身份重生，为找回记忆与恶魔战斗。两条故事线在悬疑与战斗中交织展开。