《国宝迷踪》讲述了陕西关中老腔第十二代传人王宁利为复兴传统艺术而陷入困境的故事。王宁利的儿子军娃对老腔毫无兴趣，班社成员也因生活压力准备外出打工。与此同时，盗墓贼马新科带着侄子马栓财和郭宾来到杨家村，在王宁利家的农田中发现了一处窖藏文物。王宁利等人无意中撞见了盗墓行为，文物的出现引发了村民们关于上缴或私留的激烈争论。马新科不甘心失败，假扮省文化部官员住进王宁利家，骗取了他的信任。王宁利决定上缴文物，却被马新科利用。最终，马新科的阴谋被识破，文物得以保全，老腔也被列入国家非物质文化遗产名录。王宁利和他的老腔班社带着亲友的祝福，踏上了进京演出的旅程。