《四十年》讲述了大明成化十四年，六品推官唐泛与锦衣卫总旗隋州联手破案的故事。两人因成功侦破侯爷公子遇害案而名声大振，结下深厚情谊。然而，唐泛的清贫生活并未改变，房东张氏却在密室中离奇死亡，看似自杀却疑点重重。经过调查，张氏的丈夫李漫被抓获，但不久后李漫越狱，并卷入北宋帝陵附近的多起失踪案。唐泛与隋州再次合作，最终将李漫绳之以法，却发现他只是棋子。随后，京城与地方接连发生大案，包括“侍郎夫妇横死案”和“诱拐太子案”，背后均指向朝堂势力。唐泛与隋州深入调查，揭露了东厂督主尚铭的阴谋。尚铭利用朝野势力制造混乱，铲除异己，意图谋反。最终，唐泛与隋州合力粉碎了尚铭的计划，受到嘉奖。二人继续为官清廉，惩奸除恶，为百姓谋求太平天下。