在《假面骑士零一 外传 假面骑士灭亡迅雷》中，灭亡迅雷站的成员迅被哉亚公司CEO里昂·亚克兰德绑架。灭、亡与雷前往营救时，发现里昂正大规模生产无自我意识的"士兵型修码吉亚"，企图将其作为武器贩卖全球。迅对此感到愤怒，决心阻止这一阴谋。与此同时，飞电智能的新任社长飞电或人也卷入事件，与灭亡迅雷站形成微妙对峙。随着剧情发展，双方逐渐认清真正的敌人是企图滥用AI技术的哉亚公司，最终联手对抗里昂的邪恶计划，揭露其利用修码吉亚引发全球战争的阴谋。故事延续了TV版对人工智能伦理的探讨，展现了不同立场角色在危机下的抉择与成长。