《假面骑士零一 外传 假面骑士巴尔坎与瓦尔基里》讲述了在人工智能公司“飞电智能”研发的AI机器人被“灭亡迅雷站”黑入系统后暴走的事件中，政府成立特务机关以应对AI犯罪。与此同时，哉亚日本公司发生大规模爆炸，灭亡迅雷站被怀疑为罪魁祸首。面对记者的质问，刃唯阿选择暂不回应，而假面骑士巴尔坎（不破谏）与假面骑士瓦尔基里（刃唯阿）在上级压力下不得不做出艰难抉择。他们在理解人类与修码吉亚两方的立场中，试图寻找平衡，并在这场危机中扮演关键角色。故事展现了他们在复杂局势下的信念与行动，以及面对挑战时的勇气与智慧。