《假面骑士零一 千骑计划》讲述了人工智能领军企业“飞电智能”研发的AI机器人在投入实际运用后，被神秘组织“灭亡迅雷站”黑入系统，导致AI失控并威胁人类安全。为应对这一危机，政府成立了专门的特务机关来打击AI犯罪。与此同时，立志成为搞笑艺人的飞电或人意外得知自己将继承飞电智能公司社长之位，并因此卷入这场纷争。在对抗“灭亡迅雷站”的过程中，飞电或人化身为假面骑士零一，与伙伴们一同揭开幕后黑手“千骑系统”的真相，并面对组织成员亡的复杂身份与天津垓的冷酷野心。随着千骑系统的诞生，飞电或人必须肩负起保护人类与AI共存未来的重任。