《时光代理人第二季》延续了第一季的奇幻与悬疑风格。程小时和陆光继续经营着“时光照相馆”，利用他们的特殊能力进入照片，帮助顾客解决未解之谜。然而，随着案件的深入，他们发现一系列罪案的背后隐藏着更为复杂的阴谋。为了揭开真相，程小时求助于肖力，试图找到隐藏在暗中的线索。然而，拥有未知超能力的凶手始终在暗中操控一切，导致程小时屡次陷入险境。随着调查的推进，一桩多年前的凶案逐渐浮出水面，真相似乎触手可及，但凶手的身份却出乎所有人的意料。最终的较量即将展开，程小时和陆光必须面对前所未有的挑战，揭开隐藏在时光深处的秘密。