在U.C.0097年，"拉普拉斯事变"结束后，两架独角兽高达被秘密封存。然而失踪两年的独角兽三号机"凤凰"突然重现，这架拥有改变世界秩序力量的机体立即引发了多方势力的争夺。地球联邦军、新吉翁残党"袖章"以及路欧商会三方展开激烈角逐。年轻驾驶员约拿·巴修塔奉命追查凤凰高达的下落，却意外卷入这场关乎人类未来的纷争。随着真相逐渐浮出水面，约拿必须在保护同伴与完成使命之间做出抉择，而凤凰高达背后隐藏的惊人秘密，或将彻底改变地球圈的政治格局。在这场跨越生死与信念的宇宙对决中，人性的光辉与战争的残酷交织，谱写了一曲震撼人心的太空史诗。