《通灵妃第二季》延续了第一季的故事，讲述了千云兮因身负异能而被视为不祥之人，从小被父亲抛弃，寄养在灵云山上。16年后，她被迫代替同父异母的妹妹嫁给冷酷残暴的王爷夜幽幂。新婚之夜，千云兮意外发现自己与夜幽幂之间有着神秘的羁绊。在王府中，她不仅要面对夜幽幂的冷漠与猜疑，还要应对府中其他人的刁难与陷害。然而，千云兮凭借自己的机智与善良，逐渐赢得了夜幽幂的信任与好感。两人在相处中渐生情愫，共同面对来自朝廷与江湖的种种阴谋与挑战。与此同时，千云兮的异能也逐渐觉醒，她发现自己肩负着更大的使命，必须揭开隐藏在背后的真相，保护自己所爱的人。