《种子》讲述了一个充满神秘色彩的现代奇幻故事。在人类历史背后，传说中的妖魔鬼怪其实是名为"荒神"的植物生命体，而须佐之男竟是它们的首领。奇稻田姬作为世代转生的巫女，肩负着封印荒神的重任。到了现代，这份力量意外分裂到孪生姐妹红叶和枫身上，导致封印减弱，荒神开始复苏。荒神们制造结界企图杀死红叶，而神秘少年草剃——被八歧大蛇改造的人类武器——本应执行刺杀任务，却在相处中对红叶产生了复杂情感。故事围绕着这对特殊少男少女展开，既有惊心动魄的超自然对抗，又暗藏青春情感的微妙变化，在传统神话与现代背景的交织中，谱写了一曲关于宿命与选择的奇幻篇章。