《星际旅行：下一代》第三季延续了企业号D的太空探索之旅。皮卡德舰长率领船员继续执行星际联邦的任务，在未知星系中遭遇了博格人的首次正式接触，这场危机展现了这种半机械种族的可怕同化能力。同时，船员们还面临克林贡帝国内部的政治动荡，武夫不得不在忠诚与正义间做出抉择。数据少校在本季中进一步探索人性，通过"兄弟"一集与创造者之子相遇，深化了对自我认知的追寻。特洛伊顾问的贝塔索心理能力也有重要发展，尤其在"心灵之眼"一集中展现了惊人潜力。本季还引入了标志性的Q连续故事线，这位全能的捣蛋鬼再次考验着人类文明的进步。整体剧情在保持单元剧特色的同时，开始构建更宏大的系列故事脉络。