《孖宝太子》讲述了一对孖生兄弟因宫廷阴谋被迫分离的命运。皇后遭奸人所害，刚出生的双胞胎被迫分离——兄长成为东南亚塔比亚国的蒲藤卡罗新觉王子（任达华饰），弟弟韦天富（任达华分饰）则流落香港成为洋服店裁缝。二十多年后，塔比亚国爆发政变，王子为避难来到香港，恰逢天富与导游女友潘碧云（邝美云饰）新婚。两兄弟意外重逢引发连串误会与笑料，更卷入跨国阴谋。在生母（实为流落香港的茶楼点心女工）与女友等人帮助下，兄弟二人联手对抗政变势力，最终揭穿当年宫廷阴谋，重获皇室身份。影片融合亲情、爱情与政治斗争，展现兄弟从相遇到相认的动人历程。